O Homem-Aranha se balança tranquilamente pelos prédios da cidade quando de repente seu sensor Aranha zumbi descontroladamente, então ele vê alguns capangas do Mad Bomber instalando bombas pela cidade e após deter todas as bombas o Homem-Aranha fica mais determinado a encontrar e prender o Mad Bomber. Após ser convocado pela detetive Dewoulf, ela o informa que os homens do Mad Bomber iriam explodir uma das fundações da ponte George Washington, ele vai lá e impede a explosão mas logo em seguida percebe que era só uma distração, o verdadeiro alvo era a usina nuclear da Mentacore. 

O Homem-Aranha vai até lá, bate em alguns capangas e impede uma explosão nuclear e acaba descobrindo que o Mad Bomber é Luke Carlyle e este por sua vez está querendo roubar um dos reatores da usina (provavelmente para suas bombas) e promover sua vingança contra J. Jonah Jameson, que segundo ele promoveu uma investigação que arruinou sua companhia, o Homem-Aranha consegue impedir o roubo mas não a fuga de Carlyle. 

No dia seguinte o Homem-Aranha vai até o Clarim para contar a Jameson sobre o Mad Bomber, mas antes mesmo de entrar no prédio ocorre uma explosão, ele entra no prédio e desarma algumas bombas e depois fica sabendo que Jameson foi sequestrado e após resgatá-lo o Homem-Aranha faz com que o Mad Bomber exploda o próprio helicóptero e assim ele desiste de continuar com seu plano. história começa com uma gravação do Dr. Connors para a sua família onde ele injeta o soro do lagarto nele mesmo (com o intuito de recuperar seu braço) e depois de ter um colapso a gravação acaba, depois disso Peter está no Clarim onde Jameson o informe que lagartos gigantes estavam aterrorizando pessoas do gramacy park e quer que Peter vá tirar fotos. Na primeira tentiva ele falha, mas na segunda consegue. 

Depois Peter vai fazer uma visita ao Doutor no laboratório dele, mas só encontra um Lagarto gigante com a roupa do Doutor e chega a conclusão de que era o Connors, mas este foge e Peter o segue já como Homem-Aranha ele ve que o lagarto foi para os esgotos e vai, lá ele da cara com vários lagartos (mas nenhum era o doutor) e percebe que esses lagartos também eram humanos e passando essa condição para outros humanos. Depois de várias tretas o Aranha finalmente encotra o Lagarto e eles lutam é ai que o Lagarto revela seu plano de querer transformar todos os habitantes da Terra em lagartos, mas o Aranha vence e deixa o Lagarto escapar por um lugar aonde ele não possa ser seguido.