ssassin’s Creed é um videojogo de ação/aventura não linear no qual o jogador controla Altair, cuja vida é experienciada através do Animus por Desmond Miles. O objetivo do jogo é subir de posto na Irmandade dos Assassinos fazendo uma série de missões de assassino comandadas pelo líder da Ordem, Al Mualim. Ao fazer isto, Altair viaja desde Masyaf até cidades da Terra Santa, especificamente Jerusalém, Acre e Damascos.

Quando chega a qualquer uma das cidades, Altair tem que localizar um agente da Irmandade que vai fornecer uma casa segura e algum conhecimento básico sobre o alvo. Compete a Altair reunir mais alguma informação ouvindo conversas alheias, interrogando pessoas, encontrando-se com informadores e colegas assassinos, e reunindo itens importantes. Só depois de Altair ter reunido informações suficientes é que ele pode proceder ao assassino com sucesso. Depois de completar assassinos, Altair retorna à Irmandade e é premiado com uma arma melhor e depois é-lhe dado o nome de outros alvos.

Durante a execução das missões necessárias, Desmond deve conduzir Altair a pontos altos da cidade para sincronizar as memórias dos mapas da cidade em que está presente. Outras missões secundárias incluem localizar e matar Templários, colecionar bandeiras, e salvar cidadãos que estão a ser ameaçados por guardas da cidade.

Altair precisa de executar a maior parte das missões sem atrair as atenções dos oficiais. O jogo usa um Medidor de

Nível de Alerta para informar o jogador quão notável é Altair aos indivíduos à sua volta, incluindo os guardas. A realização de certas ações a certas alturas pode ou não aumentar o nível de notabilidade na área. Se uma área está em alerta máximo, todos os cidadãos vão correr e espalhar-se em várias direções enquanto os guardas perseguem e tentam derrubar Altair. Para reduzir o nível de notabilidade, Altair tem de sair da linha de visão dos guardas, encontrar um sítio para se esconder ou misturar-se com estudiosos (que se vestem coincidentemente semelhante a Altair) ou com cidadãos sentados nos bancos.

Para realizar muitos dos assassinos o e outras várias tarefas, Altair é capaz de fazer movimentos de alto e baixo perfil, que vão afetar o nível de alerta. Movimentos de baixo perfil vão permitir que a Altair misturar nas multidões, esconder, e usar a lâmina escondida de Altair para tentar assassinos silenciosos. Movimentos de alto perfil aumentam o nível de alerta e incluem corrida livre, atacar inimigos, e tentativos de assassinos de alto perfil.