Yaiba: Ninja Gaiden Z é um jogo de hack and slash em terceira pessoa que apresenta características semelhantes aos títulos Yaiba anteriores. Os jogadores podem correr, pular, bloquear e utilizar a lâmina de Yaiba para atacar os inimigos. Além do multiplicado regular exibido no lado esquerdo da tela, o multiplicador de pontuação de Yaiba no lado direito da tela acumula a contagem de acertos de seu inimigo. O modo ‘Bloodlust’ visto em outros jogos é substituído por ‘Ultimate Technique’, que permite que Yaiba mate vários inimigos em rápida sucessão.